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php的内置函数exec，system都可以调用系统命令(shell命令)，当然还有passthru，escapeshellcmd等函数。
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php执行linux的命令用system或exec就可以，只要打开safemode，但是一些系统底层的没有执行命令的不允许调用哦，实在有些命令例如zip之类想用的话，直接用php写入一个shell脚本文件再exec那个sh就好了。
显然，你要靠php操作其范围外的文件或目录是不可能的，这是因为php的运行身份是apache，因此没办法操作root权限的文件或目录。
PHP 中执行系统命令有几种方式：system()：和 C 语言中的 system() 函数的用法是一样的，参数为命令行，成功则返回命令输出的最后一行，失败则返回 FALSE。shell_exec()：执行命令，然后返回命令执行后的 stdout 输出。
Linux系统下查看目录大小 查看目录大小的命令是du（当然也可以查看文件大小）。
1、3)CLI(命令行运行 / Command Line Interface)4)Web模块模式(Apache等Web服务器运行的模式) 5)ISAPI(Internet Server Application Program Interface)备注：在PHP3以后，PHP不再有ISAPI模式，安装后也不再有php5isapi.dll这个文件。
2、Linux 服务器上面，用 php 解释器脚本方式运行你的 php 代码。网站的 php 代码是被 web 服务器调用的。
3、因为kali自带apache2和php，所以只要开启apache服务就可以访问php文件。开启apache服务 service apache2 start 然后在浏览器中输入 localhost 如果显示apache的信息页面就是成功了。
打开我们的linux命令行，准备好。找到php的安装目录，主要是找到linux环境下，php可执行文件的目录。如图所示。笔者的目录为/opt/lampp/bin/php，将此目录记下，备用。
用php -q 文件名.php 方式把php程序当shell程序来用，用php -s把自己的php程序显示有语法高亮色彩的html源文件。这样是不是很省心？利用php的odbc功能可以在shell命令中对数据库进行操作。
linux如何启动php服务？我们一起来了解一下吧。打开linux系统，在linux的桌面的空白处右击。在弹出的下拉选项里，点击打开终端。输入/etc/init.d/php-fpmstart命令，回车即可开启PHP服务。
打开linux系统命令行界面。在命令行界面中输入如下命令：which php，回车。